Según la delegada municipal de Patrimonio, Laura Ballesteros, el aumento en el número de visitas tiene mucho que ver con la inauguración de la priemra exposición permanente del Museo: "Alcalá antes del hombre". Forma parte de ella el fósil de ballena de seis millones de años que fue encontrado en La Aceña y que ha sido donado al Ayuntamiento por Joaquín Cárdenas y restaurado por él mismo y por Vicente Maestre e Ildefonso Bajo. Sólo esta exposición registró en sus dos priemeras semanas de apertura la visita de 1.093 personas, entre acceso libre y grupos concertados.

Junto a esta muestra permanente, en esta primera mitad de 2012 han pasado por el Museo exposiciones como un "30 Miradas", que en un mes ha sumado más de 2.000 visitas; "Si un joven reportero, su perro y un capitán..." o "La cruz del inglés: 200 años de leyenda urbana", que hasta la fecha cuenta con 1.482 visitas.

La programación de los próximos meses contará con exposiciones temporales de pintores de primer nivel, como Daniel Bilbao o el ilustrador, Raúl Fernández, además de exposiciones vinculadas al patrimonio local como la de "Los rastros de la industria panadera en los paisajes de Alcalá de Guadaíra" o una muestra dedicada "La Historia de la devoción a Jesús Nazareno".